Другий етап сертифікації організовує Державна служба якості освіти. Затверджує форму анкети самооцінювання та методичні рекомендації щодо її заповнення; здійснює вивчення результатів самооцінювання педагогічної майстерності учасників сертифікації. З алгоритмом проходження другого етапу сертифікації можна ознайомитися за посиланням.
Повідомлення про допущення чи недопущення учасника сертифікації до наступного етапу ДСЯО надсилає протягом трьох робочих днів з моменту прийняття рішення на адресу електронної пошти, яку учасник зазначив під час реєстрації.